为监控污染，保护环境，减轻工程对环境的影响，1997年3月开始对小浪底工程库区及下游影响区水质进行监测。5年的监测表明，小浪底库区及下游影响区水质主要受耗氧有机物污染，干流污染重于支流，非汛期污染重于汛期，水质主要受上游来水水质、库区污染源、工程施工以及水量变化的影响。随着工程施工结束以及库区开发活动的开始，上游来水水质和开发活动可能产生的污染将成为影响小浪底库区及其下游影响区水质的主要因素。