以2002年9月底长江口综合整治开发规划水文、水质原型观测资料为依据，运用W值法分析评价长江口河段水质污染现状及其空间分布特征。监测结果表明，长江口河段总体水质属Ⅲ类，个别断面达到了Ⅳ类和Ⅴ类，有多项水质指标出现超标。主要污染因子为TN、COD_Mn、总铅、氯离子和石油类等。长江口北支水质劣于南支、北港和南港；南支南岸水质劣于北岸；城市江段水质劣于非城市江段；低平潮期水质劣于高平潮期；浅水区水质劣于深泓区；下游水质劣于上游。影响长江口河段水质的污染物既有无机物又有有机物；污染源既有生活污染源又有工业污染源；既有固定源又有流动源；既有点源又有面源；既有随径流流入的又有随潮流带入的。