采用主成分分析法和SPSS统计软件，对2007年从崇明岛河道12个水质监测点监测所得枯水期与丰水期的18个水质指标数据进行处理，从原始监测数据提取出占总方差85 ％以上的5个主成分，并计算其贡献率和12个监测点的主成分值。分析表明：枯水期，硫酸、磷酸、钾在第1主成分载荷较高，镁在第2主成分载荷较高，铁、色度、硫在第3主成分载荷较高；丰水期，钾在第1主成分载荷较高，镁、铜在第2主成分载荷较高，亚硫酸、亚硝酸在第3主成分载荷较高。据此得出结论：崇明岛水质受农业和海水倒灌的影响较大，工业对河道的影响较小。认为，应减少崇明岛农药化肥的使用，推广滴灌灌溉，防止过多的灌溉用水携化肥等流入河道；枯水期可采用人工向河道注水的方式防止海水倒灌，丰水期可依旧采取现有南进北出的方法引入长江淡水；减少崇明岛内工业企业，降低工业污染对河道的影响，并对不能搬离企业的生产过程进行严格监管，严禁工业废水未经处理直接向岛内河道排放。