跨界流域水资源问题主要包括水量分配和水污染。已有相关研究涉及了流域水环境管理体制、流域水污染治理机制、上下游利益博弈和经济补偿等诸多方面。(- 边界环保联席会议的实践表明：目前以一级政府下属的环保局为主体的跨界流域水污染联合防治机制，实质上是政府之间的共谋行为，其社会效应体现为该机制有效地协调了上下游的利益博弈，并在一定程度上遏制或避免了因经济纠纷引发的突发性事件；其生态效应却是联防机制，不仅忽视了河流生态系统，而且由于它将污染事件信息控制在内部，其结果往往是加剧了河流的水污染。