为实现金沟河流域和谐发展目标，从外部环境和内部条件两个角度，分析了金沟河流域存在产权关系不清晰、流域管理与行政区域管理界定不清、水资源管理部门分散三大弊端，以及硬件建设缺失和软件服务不到位等主要问题，提出金沟河流域和谐发展的思路:在流域和谐发展方面进行有益的尝试，协调好流域长期发展与近期建设、水量调度与灌区灌溉、水资源优化配置与节水改造、地表水与地下水、流域管理与区域管理和水资源公益性与商品性等关系。