水利部综合事业局组建之后，明确提出了“业务强局、经济强局”的战略目标，并确立了水利部综合事业局深化改革发展的思路、基本构架与方向。作为承担水利部行政管理职能延伸业务较多的单位，水利部综合事业局紧紧围绕水利中心工作，坚持业务优先的发展思路，把提高业务水平、促进水利又好又快发展作为全局工作的重中之重，注重抓好重大项目管理，注重业务规划咨询成果的积累和应用，培育和形成了一批新的业务亮点，业务发展的可持续性大大增强，形成了比较稳定的十大主体业务，基本具备了为水利事业发展提供优质、高效的管理和技术支撑能力。