从闽江流域历年主要污染物排放量、控制断面水质浓度和径流量变化三者之间关系入手，针对闽江梯级电站开发程度较高，而且绝大多数电站建成投产于1993年以后的特点，根据水体自净机理，分析梯级电站对闽江水环境的影响。结果表明：闽江梯级水库对污染物质的层层拦蓄，在相当程度上减轻了下游与河口地区污染物总量，对缓解下游与河口地区污染危害起到了积极的作用；但过量污染物长期排放，沉积的底泥对水库水质将产生深远的影响，最后提出了保护水生态环境的建议。