为解决单项水资源承载能力评价指标评价结果的不相容问题，提高水资源承载能力综合评价各层次的分辨力和评价模型的精度，采用大样本数据，利用投影寻踪、遗传算法、插值型曲线和水资源承载能力评价标准，为水资源承载能力综合评价建立了一种新的数学模型——遗传投影寻踪插值模型(GPPIM).给出了实施GPPIM的详细步骤，作为示例，对山西省水资源承载能力进行了综合评价.结果表明，GPPIM的评价结果可靠、直观、适用性强，不仅可以对水资源承载能力进行综合评价，还可以科学地确定评价指标的权重.GPPIM可广泛应用于各种水资源问题的综合评价.