为探讨湖泊综合整治工程对城市湖泊水质的改善效果，利用国家野外科学观测研究站 江苏太湖湖泊生态系统研究站1998—2009年的监测数据，结合湖体与环湖河道调查，分析了太湖五里湖综合整治工程对水质的改善效果.结果表明：综合整治之后，总氮、总磷及叶绿素a质量浓度平均值显著下降(P<001)，分别由6.06mg／L，0.183mg／L和0.060mg／L降为3.48mg／L， 0.133mg／L及0.024mg／L；而湖体透明度、悬浮颗粒物含量等感观指标无明显改善；退渔还湖区及其入湖河道水质明显优于更靠近城区的东出口区.营养盐含量环湖河道显著高于湖体 ，底泥中也较高，对湖体的生态恢复构成很大威胁.与太湖其他几个湖区相比，五里湖的营养盐含量仍然较高.研究表明，五里湖实施的综合整治措施在很大程度上改善了湖泊重污染的状况，但要获得稳定的高透明度景观水质，还需要实现湖泊水生态系统的深度调控，包括采取环湖河道的同步治理及湖体大面积沉水植被恢复等措施.