对2010年12月与2011年7月赣江中下游各监测断面中浮游动物类群的结构组成、优势类群进行调查，结果表明:赣江中下游浮游动物有4类41种;种类最多的是轮虫类，共计7科15属25种，占总数的6098％;枝角类5科6属7种，占1707％;桡足类与原生动物占2195％。时间分布上浮游动物丰度丰水期大于枯水期，密度变动范围为100～522个／L，其中丰水期轮虫、枝角类、桡足类与原生动物密度分别占浮游动物密度的617％，114％，189％与78％;枯水期轮虫、枝角类、桡足类与原生动物密度分别占浮游动物密度的653％，95％，160％与91％。浮游动物密度空间分布上呈现中间大、两端小的特点，最大值出现在4号监测点新干，最小值出现在10号监测点赣州。赣江中下游浮游动物数量结构主要由轮虫和桡足类组成，生物量结构则主要由桡足类和枝角类组成。生物多样性及水质综合评价为轻度污染至中度污染。