为了建设南水北调东线清水廊道，必须对沿线的污染源进行综合治理。通过对东线黄河以南段水质和污染源现状的分析评价，指出南四湖、上级湖及以北地区是东线污染治理的重点。提出治污基本思路：满足分期调水需求，重点控制工业和城市污染源，输水与防洪、排涝兼顾，实现污水资源化和排污总量控制。根据这个思路，介绍了治污方案的实施细则。