我国国债存在两个主要交易市场——银行间市场与交易所市场，由于相互割裂且各具特点，所得到的收益率曲线具有一定的差异。为了分辨出更有效的收益率曲线，采用Granger检验、方差分析等方法对上证所市场和银行间市场国债6个月、1年期、3年期、5年期、7年期收益率时间序列进行了研究。研究发现，两个市场收益率具有较大的相关性，但是交易所市场收益率期限结构较为陡峭，而银行间市场收益率期限结构较平坦。交易所国债收益率时间序列与银行间国债收益率时间序列在期限较短时相互影响、互为因果，但银行间收益率变化单向领先于交易所收益率变化更为显著。同时，通过方差分析发现，银行间收益率波动对交易所收益率波动的影响较大，这一点在期限较长的收益率曲线中表现尤其明显。